Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
APCP25054 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
APCP25054 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
APCP25054 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
APCP25054 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
APCP25054 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
APCP25054 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
APCP25054 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
APCP25054 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
APCP25054 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
APCP25054 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
APCP25054 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14□□□□□ -0.17
APCP25054 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
APCP25054 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
APCP25054 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
APCP25054 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
APCP25054 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
APCP25054 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
APCP25054 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
APCP25054 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
APCP25054 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
APCP25054 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
APCP25054 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
APCP25054 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
APCP25054 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
APCP25054 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
APCP25054 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
APCP25054 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
APCP25054 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
APCP25054 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
APCP25054 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC14□□□□□ -0.17
APCP25054 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APCP25054 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APCP25054 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
APCP25054 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APCP25054 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
APCP25054 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
APCP25054 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APCP25054 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APCP25054 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APCP25054 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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APCP25054 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APCP25054 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
APCP25054 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
APCP25054 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
APCP25054 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
APCP25054 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APCP25054 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APCP25054 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APCP25054 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
APCP25054 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APCP25054 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APCP25054 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
APCP25054 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APCP25054 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APCP25054 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
APCP25054 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APCP25054 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
APCP25054 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
APCP25054 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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APCP25054 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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APCP25054 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
APCP25054 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
APCP25054 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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APCP25054 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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APCP25054 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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APCP25054 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
APCP25054 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
APCP25054 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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APCP25054 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
APCP25054 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
APCP25054 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
APCP25054 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
APCP25054 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
APCP25054 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
APCP25054 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
APCP25054 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
APCP25054 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
APCP25054 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
APCP25054 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
APCP25054 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
APCP25054 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
APCP25054 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
APCP25054 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
APCP25054 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
APCP25054 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
APCP25054 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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