Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME1P15531 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME1P15531 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME1P15531 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NME1P15531 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME1P15531 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME1P15531 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME1P15531 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME1P15531 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME1P15531 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME1P15531 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME1P15531 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME1P15531 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME1P15531 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NME1P15531 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NME1P15531 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME1P15531 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NME1P15531 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME1P15531 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME1P15531 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME1P15531 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME1P15531 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME1P15531 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME1P15531 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME1P15531 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME1P15531 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME1P15531 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME1P15531 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME1P15531 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME1P15531 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME1P15531 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME1P15531 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME1P15531 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME1P15531 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME1P15531 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME1P15531 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME1P15531 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME1P15531 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME1P15531 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME1P15531 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME1P15531 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME1P15531 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME1P15531 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME1P15531 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME1P15531 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME1P15531 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME1P15531 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME1P15531 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME1P15531 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME1P15531 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME1P15531 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME1P15531 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME1P15531 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME1P15531 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME1P15531 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME1P15531 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME1P15531 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME1P15531 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME1P15531 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME1P15531 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME1P15531 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NME1P15531 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME1P15531 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NME1P15531 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME1P15531 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME1P15531 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NME1P15531 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NME1P15531 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NME1P15531 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME1P15531 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME1P15531 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME1P15531 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME1P15531 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NME1P15531 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME1P15531 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME1P15531 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME1P15531 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME1P15531 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME1P15531 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME1P15531 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NME1P15531 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME1P15531 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME1P15531 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME1P15531 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME1P15531 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME1P15531 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NME1P15531 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NME1P15531 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME1P15531 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME1P15531 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME1P15531 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME1P15531 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NME1P15531 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME1P15531 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME1P15531 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME1P15531 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME1P15531 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME1P15531 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME1P15531 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME1P15531 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms