Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD46P15529 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD46P15529 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD46P15529 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD46P15529 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD46P15529 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD46P15529 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD46P15529 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD46P15529 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD46P15529 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD46P15529 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD46P15529 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD46P15529 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD46P15529 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD46P15529 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD46P15529 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD46P15529 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD46P15529 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD46P15529 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD46P15529 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD46P15529 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD46P15529 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD46P15529 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD46P15529 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD46P15529 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD46P15529 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD46P15529 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD46P15529 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD46P15529 RAB30-AS1-205ENST00000530270 1116 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD46P15529 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD46P15529 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD46P15529 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD46P15529 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD46P15529 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD46P15529 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD46P15529 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD46P15529 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD46P15529 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD46P15529 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD46P15529 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD46P15529 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD46P15529 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD46P15529 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD46P15529 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD46P15529 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD46P15529 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD46P15529 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD46P15529 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD46P15529 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD46P15529 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD46P15529 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD46P15529 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD46P15529 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD46P15529 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD46P15529 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD46P15529 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD46P15529 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD46P15529 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD46P15529 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD46P15529 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD46P15529 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD46P15529 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD46P15529 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD46P15529 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CD46P15529 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD46P15529 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CD46P15529 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CD46P15529 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD46P15529 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD46P15529 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD46P15529 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD46P15529 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD46P15529 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD46P15529 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD46P15529 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD46P15529 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD46P15529 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CD46P15529 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD46P15529 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD46P15529 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD46P15529 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD46P15529 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD46P15529 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD46P15529 AC012370.2-204ENST00000601940 1320 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD46P15529 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD46P15529 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD46P15529 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD46P15529 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD46P15529 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD46P15529 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD46P15529 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD46P15529 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD46P15529 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD46P15529 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD46P15529 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD46P15529 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD46P15529 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD46P15529 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD46P15529 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD46P15529 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms