Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms