Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms