Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLK3P07288 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLK3P07288 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLK3P07288 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLK3P07288 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLK3P07288 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLK3P07288 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLK3P07288 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLK3P07288 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLK3P07288 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLK3P07288 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLK3P07288 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLK3P07288 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLK3P07288 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLK3P07288 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLK3P07288 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLK3P07288 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLK3P07288 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLK3P07288 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLK3P07288 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLK3P07288 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KLK3P07288 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLK3P07288 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLK3P07288 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLK3P07288 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLK3P07288 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLK3P07288 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLK3P07288 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLK3P07288 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLK3P07288 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLK3P07288 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLK3P07288 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLK3P07288 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLK3P07288 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KLK3P07288 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLK3P07288 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLK3P07288 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLK3P07288 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLK3P07288 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLK3P07288 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLK3P07288 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLK3P07288 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLK3P07288 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLK3P07288 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLK3P07288 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLK3P07288 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KLK3P07288 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KLK3P07288 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLK3P07288 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KLK3P07288 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLK3P07288 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLK3P07288 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLK3P07288 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLK3P07288 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLK3P07288 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLK3P07288 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLK3P07288 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLK3P07288 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLK3P07288 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLK3P07288 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLK3P07288 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLK3P07288 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLK3P07288 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLK3P07288 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLK3P07288 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLK3P07288 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLK3P07288 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLK3P07288 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KLK3P07288 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLK3P07288 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLK3P07288 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLK3P07288 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLK3P07288 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLK3P07288 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLK3P07288 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLK3P07288 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLK3P07288 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLK3P07288 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLK3P07288 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KLK3P07288 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLK3P07288 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KLK3P07288 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLK3P07288 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLK3P07288 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLK3P07288 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLK3P07288 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLK3P07288 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLK3P07288 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLK3P07288 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLK3P07288 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLK3P07288 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLK3P07288 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KLK3P07288 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLK3P07288 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLK3P07288 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLK3P07288 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLK3P07288 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLK3P07288 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLK3P07288 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLK3P07288 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms