Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms