Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSVO60911 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSVO60911 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSVO60911 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSVO60911 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSVO60911 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSVO60911 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSVO60911 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSVO60911 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSVO60911 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSVO60911 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSVO60911 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSVO60911 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSVO60911 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSVO60911 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSVO60911 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSVO60911 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSVO60911 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSVO60911 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSVO60911 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSVO60911 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSVO60911 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSVO60911 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSVO60911 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSVO60911 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSVO60911 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSVO60911 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSVO60911 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSVO60911 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSVO60911 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSVO60911 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSVO60911 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSVO60911 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSVO60911 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSVO60911 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSVO60911 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSVO60911 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSVO60911 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSVO60911 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSVO60911 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSVO60911 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSVO60911 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSVO60911 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSVO60911 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSVO60911 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSVO60911 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSVO60911 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSVO60911 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSVO60911 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSVO60911 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSVO60911 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSVO60911 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSVO60911 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSVO60911 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSVO60911 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSVO60911 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSVO60911 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSVO60911 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSVO60911 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSVO60911 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSVO60911 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSVO60911 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSVO60911 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSVO60911 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSVO60911 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSVO60911 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSVO60911 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSVO60911 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSVO60911 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSVO60911 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSVO60911 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSVO60911 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSVO60911 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSVO60911 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSVO60911 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSVO60911 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSVO60911 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSVO60911 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSVO60911 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSVO60911 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSVO60911 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSVO60911 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSVO60911 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSVO60911 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSVO60911 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSVO60911 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSVO60911 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSVO60911 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSVO60911 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSVO60911 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSVO60911 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSVO60911 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSVO60911 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSVO60911 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSVO60911 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSVO60911 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSVO60911 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSVO60911 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSVO60911 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSVO60911 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms