Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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