Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNPHO15079 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNPHO15079 AC008750.5-201ENST00000595500 473 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNPHO15079 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SNPHO15079 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SNPHO15079 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SNPHO15079 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNPHO15079 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNPHO15079 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNPHO15079 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNPHO15079 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNPHO15079 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNPHO15079 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNPHO15079 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNPHO15079 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNPHO15079 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNPHO15079 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNPHO15079 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNPHO15079 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNPHO15079 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNPHO15079 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNPHO15079 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNPHO15079 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNPHO15079 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNPHO15079 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNPHO15079 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNPHO15079 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNPHO15079 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNPHO15079 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNPHO15079 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNPHO15079 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNPHO15079 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNPHO15079 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNPHO15079 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNPHO15079 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNPHO15079 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNPHO15079 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNPHO15079 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNPHO15079 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNPHO15079 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNPHO15079 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNPHO15079 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNPHO15079 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNPHO15079 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNPHO15079 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNPHO15079 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNPHO15079 DEFT1P-201ENST00000453425 496 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNPHO15079 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNPHO15079 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNPHO15079 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNPHO15079 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNPHO15079 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNPHO15079 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNPHO15079 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNPHO15079 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNPHO15079 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNPHO15079 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNPHO15079 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNPHO15079 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNPHO15079 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNPHO15079 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNPHO15079 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNPHO15079 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNPHO15079 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNPHO15079 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNPHO15079 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNPHO15079 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNPHO15079 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNPHO15079 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNPHO15079 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNPHO15079 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNPHO15079 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNPHO15079 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNPHO15079 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNPHO15079 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNPHO15079 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNPHO15079 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNPHO15079 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNPHO15079 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNPHO15079 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNPHO15079 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNPHO15079 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNPHO15079 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNPHO15079 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SNPHO15079 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNPHO15079 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNPHO15079 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNPHO15079 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SNPHO15079 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNPHO15079 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNPHO15079 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNPHO15079 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNPHO15079 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNPHO15079 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNPHO15079 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNPHO15079 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNPHO15079 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNPHO15079 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNPHO15079 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNPHO15079 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms