Protein–RNA interactions for Protein: O00574

CXCR6, C-X-C chemokine receptor type 6, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR6O00574 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR6O00574 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR6O00574 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR6O00574 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR6O00574 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR6O00574 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR6O00574 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR6O00574 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR6O00574 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR6O00574 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR6O00574 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR6O00574 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR6O00574 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR6O00574 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR6O00574 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR6O00574 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR6O00574 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR6O00574 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR6O00574 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR6O00574 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR6O00574 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR6O00574 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR6O00574 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR6O00574 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR6O00574 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR6O00574 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR6O00574 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR6O00574 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR6O00574 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR6O00574 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR6O00574 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR6O00574 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR6O00574 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms