Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
E9PBE3 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
E9PBE3 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E9PBE3 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E9PBE3 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E9PBE3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E9PBE3 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E9PBE3 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E9PBE3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E9PBE3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E9PBE3 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E9PBE3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
E9PBE3 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E9PBE3 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E9PBE3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E9PBE3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E9PBE3 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E9PBE3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E9PBE3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E9PBE3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E9PBE3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E9PBE3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E9PBE3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E9PBE3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E9PBE3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E9PBE3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E9PBE3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
E9PBE3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
E9PBE3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E9PBE3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E9PBE3 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E9PBE3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E9PBE3 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E9PBE3 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E9PBE3 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E9PBE3 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E9PBE3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E9PBE3 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E9PBE3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E9PBE3 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E9PBE3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E9PBE3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E9PBE3 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E9PBE3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E9PBE3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E9PBE3 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E9PBE3 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E9PBE3 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E9PBE3 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E9PBE3 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E9PBE3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E9PBE3 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E9PBE3 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E9PBE3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E9PBE3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E9PBE3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E9PBE3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
E9PBE3 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E9PBE3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E9PBE3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
E9PBE3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E9PBE3 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E9PBE3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E9PBE3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E9PBE3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E9PBE3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E9PBE3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E9PBE3 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E9PBE3 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E9PBE3 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E9PBE3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E9PBE3 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E9PBE3 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E9PBE3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E9PBE3 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E9PBE3 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E9PBE3 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E9PBE3 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E9PBE3 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E9PBE3 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E9PBE3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E9PBE3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E9PBE3 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E9PBE3 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E9PBE3 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E9PBE3 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E9PBE3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E9PBE3 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E9PBE3 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E9PBE3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E9PBE3 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E9PBE3 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E9PBE3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
E9PBE3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E9PBE3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E9PBE3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E9PBE3 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E9PBE3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E9PBE3 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E9PBE3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms