Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf172C9J069 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms