Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVV-1B6SEH8 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms