Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HACD1B0YJ81 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms