Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A8MVJ9 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A8MVJ9 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A8MVJ9 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A8MVJ9 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A8MVJ9 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A8MVJ9 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A8MVJ9 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A8MVJ9 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A8MVJ9 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A8MVJ9 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A8MVJ9 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A8MVJ9 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A8MVJ9 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A8MVJ9 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A8MVJ9 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
A8MVJ9 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A8MVJ9 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A8MVJ9 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A8MVJ9 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
A8MVJ9 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A8MVJ9 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A8MVJ9 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A8MVJ9 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A8MVJ9 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A8MVJ9 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A8MVJ9 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A8MVJ9 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A8MVJ9 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A8MVJ9 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A8MVJ9 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A8MVJ9 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MVJ9 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MVJ9 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MVJ9 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MVJ9 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MVJ9 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MVJ9 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MVJ9 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MVJ9 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MVJ9 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MVJ9 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MVJ9 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MVJ9 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MVJ9 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MVJ9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MVJ9 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MVJ9 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MVJ9 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MVJ9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MVJ9 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MVJ9 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MVJ9 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MVJ9 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MVJ9 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MVJ9 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MVJ9 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MVJ9 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MVJ9 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MVJ9 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MVJ9 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MVJ9 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MVJ9 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MVJ9 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MVJ9 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MVJ9 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MVJ9 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MVJ9 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MVJ9 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MVJ9 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MVJ9 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MVJ9 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MVJ9 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MVJ9 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MVJ9 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MVJ9 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MVJ9 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MVJ9 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MVJ9 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MVJ9 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MVJ9 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MVJ9 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MVJ9 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MVJ9 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MVJ9 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MVJ9 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MVJ9 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MVJ9 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MVJ9 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MVJ9 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MVJ9 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MVJ9 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MVJ9 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MVJ9 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MVJ9 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MVJ9 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MVJ9 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MVJ9 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MVJ9 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MVJ9 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms