Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRRM4A7MD48 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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