Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTLL13PA6NNM8 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms