Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ARID3CA6NKF2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ARID3CA6NKF2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms