Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF316A6NFI3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF316A6NFI3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms