Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
A4D1N5 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms