Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6V7

DDX49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX49Q9Y6V7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX49Q9Y6V7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX49Q9Y6V7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX49Q9Y6V7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX49Q9Y6V7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX49Q9Y6V7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX49Q9Y6V7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX49Q9Y6V7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX49Q9Y6V7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX49Q9Y6V7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDX49Q9Y6V7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDX49Q9Y6V7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDX49Q9Y6V7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDX49Q9Y6V7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX49Q9Y6V7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX49Q9Y6V7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX49Q9Y6V7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX49Q9Y6V7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX49Q9Y6V7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX49Q9Y6V7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX49Q9Y6V7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX49Q9Y6V7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX49Q9Y6V7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX49Q9Y6V7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX49Q9Y6V7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX49Q9Y6V7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX49Q9Y6V7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX49Q9Y6V7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX49Q9Y6V7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX49Q9Y6V7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX49Q9Y6V7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX49Q9Y6V7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX49Q9Y6V7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX49Q9Y6V7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX49Q9Y6V7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX49Q9Y6V7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX49Q9Y6V7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX49Q9Y6V7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX49Q9Y6V7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDX49Q9Y6V7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDX49Q9Y6V7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDX49Q9Y6V7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDX49Q9Y6V7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDX49Q9Y6V7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDX49Q9Y6V7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDX49Q9Y6V7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDX49Q9Y6V7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DDX49Q9Y6V7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
DDX49Q9Y6V7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDX49Q9Y6V7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDX49Q9Y6V7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDX49Q9Y6V7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDX49Q9Y6V7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDX49Q9Y6V7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDX49Q9Y6V7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDX49Q9Y6V7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDX49Q9Y6V7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
DDX49Q9Y6V7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDX49Q9Y6V7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDX49Q9Y6V7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX49Q9Y6V7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX49Q9Y6V7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX49Q9Y6V7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX49Q9Y6V7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
DDX49Q9Y6V7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
DDX49Q9Y6V7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDX49Q9Y6V7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDX49Q9Y6V7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDX49Q9Y6V7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDX49Q9Y6V7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
DDX49Q9Y6V7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DDX49Q9Y6V7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DDX49Q9Y6V7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DDX49Q9Y6V7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DDX49Q9Y6V7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDX49Q9Y6V7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDX49Q9Y6V7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDX49Q9Y6V7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDX49Q9Y6V7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDX49Q9Y6V7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDX49Q9Y6V7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
DDX49Q9Y6V7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDX49Q9Y6V7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDX49Q9Y6V7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDX49Q9Y6V7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDX49Q9Y6V7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDX49Q9Y6V7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDX49Q9Y6V7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDX49Q9Y6V7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDX49Q9Y6V7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDX49Q9Y6V7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX49Q9Y6V7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX49Q9Y6V7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX49Q9Y6V7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX49Q9Y6V7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX49Q9Y6V7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX49Q9Y6V7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX49Q9Y6V7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DDX49Q9Y6V7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DDX49Q9Y6V7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms