Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y343

SNX24, Sorting nexin-24, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX24Q9Y343 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX24Q9Y343 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX24Q9Y343 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX24Q9Y343 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX24Q9Y343 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX24Q9Y343 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX24Q9Y343 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX24Q9Y343 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX24Q9Y343 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX24Q9Y343 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX24Q9Y343 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX24Q9Y343 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX24Q9Y343 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX24Q9Y343 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX24Q9Y343 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX24Q9Y343 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX24Q9Y343 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX24Q9Y343 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX24Q9Y343 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX24Q9Y343 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX24Q9Y343 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX24Q9Y343 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX24Q9Y343 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX24Q9Y343 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX24Q9Y343 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX24Q9Y343 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX24Q9Y343 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX24Q9Y343 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX24Q9Y343 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX24Q9Y343 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX24Q9Y343 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SNX24Q9Y343 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SNX24Q9Y343 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX24Q9Y343 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNX24Q9Y343 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNX24Q9Y343 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNX24Q9Y343 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNX24Q9Y343 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX24Q9Y343 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX24Q9Y343 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX24Q9Y343 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX24Q9Y343 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX24Q9Y343 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX24Q9Y343 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX24Q9Y343 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms