Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM2

ZNF490, Zinc finger protein 490, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF490Q9ULM2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF490Q9ULM2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF490Q9ULM2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF490Q9ULM2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF490Q9ULM2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF490Q9ULM2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF490Q9ULM2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF490Q9ULM2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF490Q9ULM2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF490Q9ULM2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF490Q9ULM2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF490Q9ULM2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF490Q9ULM2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF490Q9ULM2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF490Q9ULM2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF490Q9ULM2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF490Q9ULM2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF490Q9ULM2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF490Q9ULM2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF490Q9ULM2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF490Q9ULM2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF490Q9ULM2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF490Q9ULM2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF490Q9ULM2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ZNF490Q9ULM2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF490Q9ULM2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF490Q9ULM2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF490Q9ULM2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF490Q9ULM2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF490Q9ULM2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF490Q9ULM2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF490Q9ULM2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF490Q9ULM2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF490Q9ULM2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF490Q9ULM2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF490Q9ULM2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF490Q9ULM2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF490Q9ULM2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF490Q9ULM2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF490Q9ULM2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF490Q9ULM2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF490Q9ULM2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF490Q9ULM2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF490Q9ULM2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF490Q9ULM2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF490Q9ULM2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF490Q9ULM2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF490Q9ULM2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF490Q9ULM2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF490Q9ULM2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF490Q9ULM2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF490Q9ULM2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF490Q9ULM2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF490Q9ULM2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF490Q9ULM2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF490Q9ULM2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF490Q9ULM2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF490Q9ULM2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF490Q9ULM2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF490Q9ULM2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF490Q9ULM2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF490Q9ULM2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF490Q9ULM2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF490Q9ULM2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF490Q9ULM2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF490Q9ULM2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF490Q9ULM2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF490Q9ULM2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF490Q9ULM2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF490Q9ULM2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF490Q9ULM2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF490Q9ULM2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF490Q9ULM2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF490Q9ULM2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF490Q9ULM2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF490Q9ULM2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF490Q9ULM2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF490Q9ULM2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF490Q9ULM2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF490Q9ULM2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF490Q9ULM2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF490Q9ULM2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF490Q9ULM2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF490Q9ULM2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF490Q9ULM2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF490Q9ULM2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF490Q9ULM2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF490Q9ULM2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF490Q9ULM2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF490Q9ULM2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF490Q9ULM2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF490Q9ULM2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF490Q9ULM2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF490Q9ULM2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF490Q9ULM2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF490Q9ULM2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF490Q9ULM2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF490Q9ULM2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF490Q9ULM2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF490Q9ULM2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms