Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
ZNF608Q9ULD9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC40.84■■■■■ 4.13
ZNF608Q9ULD9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
ZNF608Q9ULD9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
ZNF608Q9ULD9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC40.83■■■■■ 4.13
ZNF608Q9ULD9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC40.83■■■■■ 4.13
ZNF608Q9ULD9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC40.83■■■■■ 4.13
ZNF608Q9ULD9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
ZNF608Q9ULD9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC40.83■■■■■ 4.13
ZNF608Q9ULD9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
ZNF608Q9ULD9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC40.83■■■■■ 4.13
ZNF608Q9ULD9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
ZNF608Q9ULD9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.12
ZNF608Q9ULD9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC40.82■■■■■ 4.12
ZNF608Q9ULD9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.12
ZNF608Q9ULD9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC40.81■■■■■ 4.12
ZNF608Q9ULD9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC40.81■■■■■ 4.12
ZNF608Q9ULD9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
ZNF608Q9ULD9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC40.8■■■■■ 4.12
ZNF608Q9ULD9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC40.8■■■■■ 4.12
ZNF608Q9ULD9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC40.8■■■■■ 4.12
ZNF608Q9ULD9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC40.8■■■■■ 4.12
ZNF608Q9ULD9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
ZNF608Q9ULD9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
ZNF608Q9ULD9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC40.79■■■■■ 4.12
ZNF608Q9ULD9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC40.79■■■■■ 4.12
ZNF608Q9ULD9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
ZNF608Q9ULD9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
ZNF608Q9ULD9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
ZNF608Q9ULD9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
ZNF608Q9ULD9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
ZNF608Q9ULD9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
ZNF608Q9ULD9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC40.76■■■■■ 4.12
ZNF608Q9ULD9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.12
ZNF608Q9ULD9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.11
ZNF608Q9ULD9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
ZNF608Q9ULD9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
ZNF608Q9ULD9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC40.75■■■■■ 4.11
ZNF608Q9ULD9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
ZNF608Q9ULD9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
ZNF608Q9ULD9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
ZNF608Q9ULD9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
ZNF608Q9ULD9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
ZNF608Q9ULD9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
ZNF608Q9ULD9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC40.73■■■■■ 4.11
ZNF608Q9ULD9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC40.73■■■■■ 4.11
ZNF608Q9ULD9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC40.73■■■■■ 4.11
ZNF608Q9ULD9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
ZNF608Q9ULD9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
ZNF608Q9ULD9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
ZNF608Q9ULD9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
ZNF608Q9ULD9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
ZNF608Q9ULD9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
ZNF608Q9ULD9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
ZNF608Q9ULD9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC40.72■■■■■ 4.11
ZNF608Q9ULD9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
ZNF608Q9ULD9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC40.7■■■■■ 4.11
ZNF608Q9ULD9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
ZNF608Q9ULD9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
ZNF608Q9ULD9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
ZNF608Q9ULD9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC40.69■■■■■ 4.1
ZNF608Q9ULD9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC40.68■■■■■ 4.1
ZNF608Q9ULD9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC40.68■■■■■ 4.1
ZNF608Q9ULD9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
ZNF608Q9ULD9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
ZNF608Q9ULD9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
ZNF608Q9ULD9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
ZNF608Q9ULD9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
ZNF608Q9ULD9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
ZNF608Q9ULD9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC40.66■■■■■ 4.1
ZNF608Q9ULD9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
ZNF608Q9ULD9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
ZNF608Q9ULD9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
ZNF608Q9ULD9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
ZNF608Q9ULD9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
ZNF608Q9ULD9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
ZNF608Q9ULD9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC40.65■■■■■ 4.1
ZNF608Q9ULD9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
ZNF608Q9ULD9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
ZNF608Q9ULD9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC40.63■■■■■ 4.1
ZNF608Q9ULD9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
ZNF608Q9ULD9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
ZNF608Q9ULD9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC40.62■■■■■ 4.09
ZNF608Q9ULD9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
ZNF608Q9ULD9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC40.62■■■■■ 4.09
ZNF608Q9ULD9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
ZNF608Q9ULD9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
ZNF608Q9ULD9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
ZNF608Q9ULD9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
ZNF608Q9ULD9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC40.6■■■■■ 4.09
ZNF608Q9ULD9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
ZNF608Q9ULD9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
ZNF608Q9ULD9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC40.58■■■■■ 4.09
ZNF608Q9ULD9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
ZNF608Q9ULD9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
ZNF608Q9ULD9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
ZNF608Q9ULD9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC40.57■■■■■ 4.09
ZNF608Q9ULD9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.09
ZNF608Q9ULD9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC40.57■■■■■ 4.09
ZNF608Q9ULD9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms