Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHK0

NUFIP1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUFIP1Q9UHK0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUFIP1Q9UHK0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUFIP1Q9UHK0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUFIP1Q9UHK0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NUFIP1Q9UHK0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUFIP1Q9UHK0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUFIP1Q9UHK0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUFIP1Q9UHK0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUFIP1Q9UHK0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUFIP1Q9UHK0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUFIP1Q9UHK0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUFIP1Q9UHK0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUFIP1Q9UHK0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUFIP1Q9UHK0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUFIP1Q9UHK0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUFIP1Q9UHK0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUFIP1Q9UHK0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUFIP1Q9UHK0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUFIP1Q9UHK0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUFIP1Q9UHK0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUFIP1Q9UHK0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUFIP1Q9UHK0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUFIP1Q9UHK0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUFIP1Q9UHK0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUFIP1Q9UHK0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUFIP1Q9UHK0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NUFIP1Q9UHK0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NUFIP1Q9UHK0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUFIP1Q9UHK0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NUFIP1Q9UHK0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NUFIP1Q9UHK0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUFIP1Q9UHK0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUFIP1Q9UHK0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUFIP1Q9UHK0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUFIP1Q9UHK0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NUFIP1Q9UHK0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NUFIP1Q9UHK0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NUFIP1Q9UHK0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NUFIP1Q9UHK0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUFIP1Q9UHK0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUFIP1Q9UHK0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUFIP1Q9UHK0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUFIP1Q9UHK0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NUFIP1Q9UHK0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUFIP1Q9UHK0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NUFIP1Q9UHK0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUFIP1Q9UHK0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUFIP1Q9UHK0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUFIP1Q9UHK0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUFIP1Q9UHK0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NUFIP1Q9UHK0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NUFIP1Q9UHK0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NUFIP1Q9UHK0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUFIP1Q9UHK0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUFIP1Q9UHK0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUFIP1Q9UHK0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NUFIP1Q9UHK0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUFIP1Q9UHK0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUFIP1Q9UHK0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUFIP1Q9UHK0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUFIP1Q9UHK0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
NUFIP1Q9UHK0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NUFIP1Q9UHK0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUFIP1Q9UHK0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUFIP1Q9UHK0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUFIP1Q9UHK0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUFIP1Q9UHK0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUFIP1Q9UHK0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NUFIP1Q9UHK0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUFIP1Q9UHK0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NUFIP1Q9UHK0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NUFIP1Q9UHK0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NUFIP1Q9UHK0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUFIP1Q9UHK0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NUFIP1Q9UHK0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUFIP1Q9UHK0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUFIP1Q9UHK0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NUFIP1Q9UHK0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUFIP1Q9UHK0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUFIP1Q9UHK0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUFIP1Q9UHK0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NUFIP1Q9UHK0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUFIP1Q9UHK0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUFIP1Q9UHK0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUFIP1Q9UHK0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUFIP1Q9UHK0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUFIP1Q9UHK0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUFIP1Q9UHK0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUFIP1Q9UHK0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUFIP1Q9UHK0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUFIP1Q9UHK0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUFIP1Q9UHK0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUFIP1Q9UHK0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUFIP1Q9UHK0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUFIP1Q9UHK0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUFIP1Q9UHK0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUFIP1Q9UHK0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUFIP1Q9UHK0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUFIP1Q9UHK0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUFIP1Q9UHK0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms