Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC17A6Q9P2U8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC17A6Q9P2U8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC17A6Q9P2U8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC17A6Q9P2U8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC17A6Q9P2U8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC17A6Q9P2U8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC17A6Q9P2U8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC17A6Q9P2U8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC17A6Q9P2U8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC17A6Q9P2U8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC17A6Q9P2U8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC17A6Q9P2U8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC17A6Q9P2U8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC17A6Q9P2U8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC17A6Q9P2U8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC17A6Q9P2U8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC17A6Q9P2U8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC17A6Q9P2U8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC17A6Q9P2U8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC17A6Q9P2U8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC17A6Q9P2U8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC17A6Q9P2U8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC17A6Q9P2U8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC17A6Q9P2U8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC17A6Q9P2U8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC17A6Q9P2U8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC17A6Q9P2U8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC17A6Q9P2U8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC17A6Q9P2U8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC17A6Q9P2U8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC17A6Q9P2U8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC17A6Q9P2U8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC17A6Q9P2U8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC17A6Q9P2U8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC17A6Q9P2U8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC17A6Q9P2U8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC17A6Q9P2U8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC17A6Q9P2U8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC17A6Q9P2U8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC17A6Q9P2U8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC17A6Q9P2U8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC17A6Q9P2U8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC17A6Q9P2U8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC17A6Q9P2U8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC17A6Q9P2U8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC17A6Q9P2U8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC17A6Q9P2U8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC17A6Q9P2U8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC17A6Q9P2U8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC17A6Q9P2U8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC17A6Q9P2U8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC17A6Q9P2U8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC17A6Q9P2U8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC17A6Q9P2U8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC17A6Q9P2U8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC17A6Q9P2U8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC17A6Q9P2U8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC17A6Q9P2U8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC17A6Q9P2U8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC17A6Q9P2U8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC17A6Q9P2U8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC17A6Q9P2U8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC17A6Q9P2U8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC17A6Q9P2U8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC17A6Q9P2U8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC17A6Q9P2U8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC17A6Q9P2U8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC17A6Q9P2U8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC17A6Q9P2U8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC17A6Q9P2U8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC17A6Q9P2U8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC17A6Q9P2U8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC17A6Q9P2U8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC17A6Q9P2U8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC17A6Q9P2U8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC17A6Q9P2U8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC17A6Q9P2U8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC17A6Q9P2U8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC17A6Q9P2U8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC17A6Q9P2U8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC17A6Q9P2U8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC17A6Q9P2U8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC17A6Q9P2U8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC17A6Q9P2U8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC17A6Q9P2U8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC17A6Q9P2U8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC17A6Q9P2U8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC17A6Q9P2U8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC17A6Q9P2U8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC17A6Q9P2U8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC17A6Q9P2U8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC17A6Q9P2U8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC17A6Q9P2U8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC17A6Q9P2U8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC17A6Q9P2U8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC17A6Q9P2U8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC17A6Q9P2U8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC17A6Q9P2U8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC17A6Q9P2U8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms