Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
REREQ9P2R6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
REREQ9P2R6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
REREQ9P2R6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
REREQ9P2R6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
REREQ9P2R6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
REREQ9P2R6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
REREQ9P2R6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
REREQ9P2R6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
REREQ9P2R6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
REREQ9P2R6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
REREQ9P2R6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
REREQ9P2R6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
REREQ9P2R6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
REREQ9P2R6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
REREQ9P2R6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
REREQ9P2R6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
REREQ9P2R6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
REREQ9P2R6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
REREQ9P2R6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
REREQ9P2R6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
REREQ9P2R6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
REREQ9P2R6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
REREQ9P2R6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
REREQ9P2R6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
REREQ9P2R6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
REREQ9P2R6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
REREQ9P2R6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
REREQ9P2R6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
REREQ9P2R6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
REREQ9P2R6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
REREQ9P2R6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
REREQ9P2R6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC36.23■■■■□ 3.39
REREQ9P2R6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
REREQ9P2R6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
REREQ9P2R6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
REREQ9P2R6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
REREQ9P2R6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
REREQ9P2R6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC36.23■■■■□ 3.39
REREQ9P2R6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC36.23■■■■□ 3.39
REREQ9P2R6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
REREQ9P2R6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
REREQ9P2R6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
REREQ9P2R6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
REREQ9P2R6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
REREQ9P2R6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
REREQ9P2R6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
REREQ9P2R6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
REREQ9P2R6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
REREQ9P2R6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
REREQ9P2R6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
REREQ9P2R6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
REREQ9P2R6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
REREQ9P2R6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
REREQ9P2R6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
REREQ9P2R6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
REREQ9P2R6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
REREQ9P2R6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
REREQ9P2R6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
REREQ9P2R6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
REREQ9P2R6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC36.17■■■■□ 3.38
REREQ9P2R6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
REREQ9P2R6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
REREQ9P2R6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
REREQ9P2R6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
REREQ9P2R6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
REREQ9P2R6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
REREQ9P2R6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
REREQ9P2R6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
REREQ9P2R6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
REREQ9P2R6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
REREQ9P2R6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
REREQ9P2R6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
REREQ9P2R6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
REREQ9P2R6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
REREQ9P2R6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
REREQ9P2R6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
REREQ9P2R6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
REREQ9P2R6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
REREQ9P2R6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
REREQ9P2R6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
REREQ9P2R6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
REREQ9P2R6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
REREQ9P2R6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
REREQ9P2R6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
REREQ9P2R6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
REREQ9P2R6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC36.09■■■■□ 3.37
REREQ9P2R6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
REREQ9P2R6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
REREQ9P2R6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
REREQ9P2R6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
REREQ9P2R6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
REREQ9P2R6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
REREQ9P2R6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
REREQ9P2R6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
REREQ9P2R6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
REREQ9P2R6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
REREQ9P2R6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
REREQ9P2R6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
REREQ9P2R6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms