Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ09

UBAP1, Ubiquitin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP1Q9NZ09 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBAP1Q9NZ09 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UBAP1Q9NZ09 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBAP1Q9NZ09 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBAP1Q9NZ09 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBAP1Q9NZ09 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBAP1Q9NZ09 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBAP1Q9NZ09 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UBAP1Q9NZ09 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBAP1Q9NZ09 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBAP1Q9NZ09 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBAP1Q9NZ09 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBAP1Q9NZ09 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBAP1Q9NZ09 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBAP1Q9NZ09 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBAP1Q9NZ09 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBAP1Q9NZ09 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBAP1Q9NZ09 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBAP1Q9NZ09 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBAP1Q9NZ09 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBAP1Q9NZ09 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBAP1Q9NZ09 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBAP1Q9NZ09 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBAP1Q9NZ09 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBAP1Q9NZ09 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBAP1Q9NZ09 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBAP1Q9NZ09 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBAP1Q9NZ09 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBAP1Q9NZ09 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBAP1Q9NZ09 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBAP1Q9NZ09 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBAP1Q9NZ09 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBAP1Q9NZ09 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBAP1Q9NZ09 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UBAP1Q9NZ09 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBAP1Q9NZ09 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBAP1Q9NZ09 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBAP1Q9NZ09 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBAP1Q9NZ09 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBAP1Q9NZ09 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBAP1Q9NZ09 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBAP1Q9NZ09 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBAP1Q9NZ09 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBAP1Q9NZ09 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBAP1Q9NZ09 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBAP1Q9NZ09 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBAP1Q9NZ09 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBAP1Q9NZ09 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBAP1Q9NZ09 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UBAP1Q9NZ09 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UBAP1Q9NZ09 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBAP1Q9NZ09 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBAP1Q9NZ09 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBAP1Q9NZ09 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBAP1Q9NZ09 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBAP1Q9NZ09 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBAP1Q9NZ09 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBAP1Q9NZ09 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBAP1Q9NZ09 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBAP1Q9NZ09 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBAP1Q9NZ09 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBAP1Q9NZ09 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBAP1Q9NZ09 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBAP1Q9NZ09 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBAP1Q9NZ09 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBAP1Q9NZ09 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBAP1Q9NZ09 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBAP1Q9NZ09 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBAP1Q9NZ09 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBAP1Q9NZ09 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UBAP1Q9NZ09 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBAP1Q9NZ09 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBAP1Q9NZ09 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBAP1Q9NZ09 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBAP1Q9NZ09 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBAP1Q9NZ09 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBAP1Q9NZ09 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBAP1Q9NZ09 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBAP1Q9NZ09 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBAP1Q9NZ09 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBAP1Q9NZ09 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBAP1Q9NZ09 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBAP1Q9NZ09 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBAP1Q9NZ09 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBAP1Q9NZ09 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBAP1Q9NZ09 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBAP1Q9NZ09 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBAP1Q9NZ09 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBAP1Q9NZ09 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBAP1Q9NZ09 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBAP1Q9NZ09 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBAP1Q9NZ09 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBAP1Q9NZ09 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBAP1Q9NZ09 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBAP1Q9NZ09 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBAP1Q9NZ09 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBAP1Q9NZ09 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBAP1Q9NZ09 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBAP1Q9NZ09 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBAP1Q9NZ09 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms