Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms