Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN7

ACER3, Alkaline ceramidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3Q9NUN7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACER3Q9NUN7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACER3Q9NUN7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACER3Q9NUN7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACER3Q9NUN7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACER3Q9NUN7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ACER3Q9NUN7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACER3Q9NUN7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACER3Q9NUN7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACER3Q9NUN7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACER3Q9NUN7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACER3Q9NUN7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACER3Q9NUN7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ACER3Q9NUN7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACER3Q9NUN7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACER3Q9NUN7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ACER3Q9NUN7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACER3Q9NUN7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ACER3Q9NUN7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACER3Q9NUN7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACER3Q9NUN7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACER3Q9NUN7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACER3Q9NUN7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACER3Q9NUN7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACER3Q9NUN7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACER3Q9NUN7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACER3Q9NUN7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ACER3Q9NUN7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACER3Q9NUN7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACER3Q9NUN7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACER3Q9NUN7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACER3Q9NUN7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACER3Q9NUN7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ACER3Q9NUN7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACER3Q9NUN7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACER3Q9NUN7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACER3Q9NUN7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACER3Q9NUN7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACER3Q9NUN7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACER3Q9NUN7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACER3Q9NUN7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACER3Q9NUN7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACER3Q9NUN7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACER3Q9NUN7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACER3Q9NUN7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ACER3Q9NUN7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACER3Q9NUN7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACER3Q9NUN7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACER3Q9NUN7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACER3Q9NUN7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACER3Q9NUN7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACER3Q9NUN7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACER3Q9NUN7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACER3Q9NUN7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACER3Q9NUN7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACER3Q9NUN7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACER3Q9NUN7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACER3Q9NUN7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ACER3Q9NUN7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACER3Q9NUN7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACER3Q9NUN7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACER3Q9NUN7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACER3Q9NUN7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACER3Q9NUN7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACER3Q9NUN7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACER3Q9NUN7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACER3Q9NUN7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACER3Q9NUN7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACER3Q9NUN7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACER3Q9NUN7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACER3Q9NUN7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACER3Q9NUN7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACER3Q9NUN7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ACER3Q9NUN7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACER3Q9NUN7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ACER3Q9NUN7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACER3Q9NUN7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACER3Q9NUN7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACER3Q9NUN7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACER3Q9NUN7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ACER3Q9NUN7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACER3Q9NUN7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACER3Q9NUN7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACER3Q9NUN7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACER3Q9NUN7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACER3Q9NUN7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACER3Q9NUN7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACER3Q9NUN7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACER3Q9NUN7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACER3Q9NUN7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACER3Q9NUN7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACER3Q9NUN7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACER3Q9NUN7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ACER3Q9NUN7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACER3Q9NUN7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACER3Q9NUN7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACER3Q9NUN7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACER3Q9NUN7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACER3Q9NUN7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACER3Q9NUN7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.8 ms