Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNTG1Q9NSN8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNTG1Q9NSN8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SNTG1Q9NSN8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SNTG1Q9NSN8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNTG1Q9NSN8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNTG1Q9NSN8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNTG1Q9NSN8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNTG1Q9NSN8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNTG1Q9NSN8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNTG1Q9NSN8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNTG1Q9NSN8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNTG1Q9NSN8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNTG1Q9NSN8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNTG1Q9NSN8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNTG1Q9NSN8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNTG1Q9NSN8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNTG1Q9NSN8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNTG1Q9NSN8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNTG1Q9NSN8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNTG1Q9NSN8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNTG1Q9NSN8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNTG1Q9NSN8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNTG1Q9NSN8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNTG1Q9NSN8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNTG1Q9NSN8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNTG1Q9NSN8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNTG1Q9NSN8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNTG1Q9NSN8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNTG1Q9NSN8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNTG1Q9NSN8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNTG1Q9NSN8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNTG1Q9NSN8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNTG1Q9NSN8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNTG1Q9NSN8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNTG1Q9NSN8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNTG1Q9NSN8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNTG1Q9NSN8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNTG1Q9NSN8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNTG1Q9NSN8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNTG1Q9NSN8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNTG1Q9NSN8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNTG1Q9NSN8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNTG1Q9NSN8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SNTG1Q9NSN8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SNTG1Q9NSN8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNTG1Q9NSN8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNTG1Q9NSN8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNTG1Q9NSN8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNTG1Q9NSN8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SNTG1Q9NSN8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNTG1Q9NSN8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNTG1Q9NSN8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNTG1Q9NSN8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNTG1Q9NSN8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNTG1Q9NSN8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNTG1Q9NSN8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNTG1Q9NSN8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNTG1Q9NSN8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNTG1Q9NSN8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNTG1Q9NSN8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNTG1Q9NSN8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNTG1Q9NSN8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNTG1Q9NSN8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNTG1Q9NSN8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNTG1Q9NSN8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNTG1Q9NSN8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNTG1Q9NSN8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNTG1Q9NSN8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNTG1Q9NSN8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNTG1Q9NSN8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNTG1Q9NSN8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNTG1Q9NSN8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNTG1Q9NSN8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SNTG1Q9NSN8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SNTG1Q9NSN8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SNTG1Q9NSN8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNTG1Q9NSN8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SNTG1Q9NSN8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNTG1Q9NSN8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNTG1Q9NSN8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNTG1Q9NSN8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNTG1Q9NSN8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNTG1Q9NSN8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SNTG1Q9NSN8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNTG1Q9NSN8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNTG1Q9NSN8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNTG1Q9NSN8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNTG1Q9NSN8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNTG1Q9NSN8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms