Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA8

EIF4ENIF1, Eukaryotic translation initiation factor 4E transporter, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 985 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4ENIF1Q9NRA8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EIF4ENIF1Q9NRA8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EIF4ENIF1Q9NRA8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
EIF4ENIF1Q9NRA8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
EIF4ENIF1Q9NRA8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
EIF4ENIF1Q9NRA8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
EIF4ENIF1Q9NRA8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
EIF4ENIF1Q9NRA8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EIF4ENIF1Q9NRA8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EIF4ENIF1Q9NRA8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EIF4ENIF1Q9NRA8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EIF4ENIF1Q9NRA8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EIF4ENIF1Q9NRA8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EIF4ENIF1Q9NRA8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EIF4ENIF1Q9NRA8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EIF4ENIF1Q9NRA8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EIF4ENIF1Q9NRA8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EIF4ENIF1Q9NRA8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EIF4ENIF1Q9NRA8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EIF4ENIF1Q9NRA8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EIF4ENIF1Q9NRA8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EIF4ENIF1Q9NRA8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
EIF4ENIF1Q9NRA8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EIF4ENIF1Q9NRA8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EIF4ENIF1Q9NRA8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EIF4ENIF1Q9NRA8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EIF4ENIF1Q9NRA8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EIF4ENIF1Q9NRA8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EIF4ENIF1Q9NRA8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EIF4ENIF1Q9NRA8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EIF4ENIF1Q9NRA8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EIF4ENIF1Q9NRA8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EIF4ENIF1Q9NRA8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EIF4ENIF1Q9NRA8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EIF4ENIF1Q9NRA8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EIF4ENIF1Q9NRA8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
EIF4ENIF1Q9NRA8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
EIF4ENIF1Q9NRA8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
EIF4ENIF1Q9NRA8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
EIF4ENIF1Q9NRA8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
EIF4ENIF1Q9NRA8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
EIF4ENIF1Q9NRA8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EIF4ENIF1Q9NRA8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EIF4ENIF1Q9NRA8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EIF4ENIF1Q9NRA8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
EIF4ENIF1Q9NRA8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EIF4ENIF1Q9NRA8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EIF4ENIF1Q9NRA8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EIF4ENIF1Q9NRA8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EIF4ENIF1Q9NRA8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EIF4ENIF1Q9NRA8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EIF4ENIF1Q9NRA8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EIF4ENIF1Q9NRA8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EIF4ENIF1Q9NRA8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EIF4ENIF1Q9NRA8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
EIF4ENIF1Q9NRA8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EIF4ENIF1Q9NRA8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EIF4ENIF1Q9NRA8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EIF4ENIF1Q9NRA8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EIF4ENIF1Q9NRA8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EIF4ENIF1Q9NRA8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EIF4ENIF1Q9NRA8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EIF4ENIF1Q9NRA8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EIF4ENIF1Q9NRA8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EIF4ENIF1Q9NRA8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EIF4ENIF1Q9NRA8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EIF4ENIF1Q9NRA8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EIF4ENIF1Q9NRA8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
EIF4ENIF1Q9NRA8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EIF4ENIF1Q9NRA8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EIF4ENIF1Q9NRA8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EIF4ENIF1Q9NRA8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
EIF4ENIF1Q9NRA8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EIF4ENIF1Q9NRA8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EIF4ENIF1Q9NRA8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
EIF4ENIF1Q9NRA8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EIF4ENIF1Q9NRA8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EIF4ENIF1Q9NRA8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EIF4ENIF1Q9NRA8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EIF4ENIF1Q9NRA8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EIF4ENIF1Q9NRA8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EIF4ENIF1Q9NRA8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EIF4ENIF1Q9NRA8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EIF4ENIF1Q9NRA8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EIF4ENIF1Q9NRA8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EIF4ENIF1Q9NRA8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EIF4ENIF1Q9NRA8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
EIF4ENIF1Q9NRA8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
EIF4ENIF1Q9NRA8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EIF4ENIF1Q9NRA8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EIF4ENIF1Q9NRA8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms