Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BIN3Q9NQY0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BIN3Q9NQY0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BIN3Q9NQY0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BIN3Q9NQY0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BIN3Q9NQY0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BIN3Q9NQY0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BIN3Q9NQY0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BIN3Q9NQY0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BIN3Q9NQY0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BIN3Q9NQY0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BIN3Q9NQY0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BIN3Q9NQY0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BIN3Q9NQY0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BIN3Q9NQY0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BIN3Q9NQY0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BIN3Q9NQY0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BIN3Q9NQY0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BIN3Q9NQY0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BIN3Q9NQY0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BIN3Q9NQY0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BIN3Q9NQY0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BIN3Q9NQY0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BIN3Q9NQY0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BIN3Q9NQY0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BIN3Q9NQY0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BIN3Q9NQY0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BIN3Q9NQY0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BIN3Q9NQY0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
BIN3Q9NQY0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BIN3Q9NQY0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BIN3Q9NQY0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
BIN3Q9NQY0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BIN3Q9NQY0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BIN3Q9NQY0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BIN3Q9NQY0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BIN3Q9NQY0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BIN3Q9NQY0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BIN3Q9NQY0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BIN3Q9NQY0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BIN3Q9NQY0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BIN3Q9NQY0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BIN3Q9NQY0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BIN3Q9NQY0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BIN3Q9NQY0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms