Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQQ7

SLC35C2, Solute carrier family 35 member C2, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35C2Q9NQQ7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC35C2Q9NQQ7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC35C2Q9NQQ7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC35C2Q9NQQ7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC35C2Q9NQQ7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC35C2Q9NQQ7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC35C2Q9NQQ7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC35C2Q9NQQ7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC35C2Q9NQQ7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC35C2Q9NQQ7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC35C2Q9NQQ7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC35C2Q9NQQ7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC35C2Q9NQQ7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC35C2Q9NQQ7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC35C2Q9NQQ7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC35C2Q9NQQ7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC35C2Q9NQQ7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC35C2Q9NQQ7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC35C2Q9NQQ7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC35C2Q9NQQ7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC35C2Q9NQQ7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC35C2Q9NQQ7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC35C2Q9NQQ7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC35C2Q9NQQ7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC35C2Q9NQQ7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC35C2Q9NQQ7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC35C2Q9NQQ7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC35C2Q9NQQ7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC35C2Q9NQQ7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC35C2Q9NQQ7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC35C2Q9NQQ7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC35C2Q9NQQ7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC35C2Q9NQQ7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC35C2Q9NQQ7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC35C2Q9NQQ7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC35C2Q9NQQ7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC35C2Q9NQQ7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC35C2Q9NQQ7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC35C2Q9NQQ7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC35C2Q9NQQ7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC35C2Q9NQQ7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC35C2Q9NQQ7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC35C2Q9NQQ7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC35C2Q9NQQ7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC35C2Q9NQQ7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC35C2Q9NQQ7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC35C2Q9NQQ7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC35C2Q9NQQ7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC35C2Q9NQQ7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC35C2Q9NQQ7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC35C2Q9NQQ7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC35C2Q9NQQ7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC35C2Q9NQQ7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC35C2Q9NQQ7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC35C2Q9NQQ7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC35C2Q9NQQ7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC35C2Q9NQQ7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC35C2Q9NQQ7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC35C2Q9NQQ7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC35C2Q9NQQ7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC35C2Q9NQQ7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC35C2Q9NQQ7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC35C2Q9NQQ7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC35C2Q9NQQ7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC35C2Q9NQQ7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC35C2Q9NQQ7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC35C2Q9NQQ7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC35C2Q9NQQ7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC35C2Q9NQQ7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC35C2Q9NQQ7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC35C2Q9NQQ7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC35C2Q9NQQ7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC35C2Q9NQQ7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC35C2Q9NQQ7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC35C2Q9NQQ7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC35C2Q9NQQ7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC35C2Q9NQQ7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC35C2Q9NQQ7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC35C2Q9NQQ7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC35C2Q9NQQ7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC35C2Q9NQQ7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC35C2Q9NQQ7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC35C2Q9NQQ7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC35C2Q9NQQ7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC35C2Q9NQQ7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC35C2Q9NQQ7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC35C2Q9NQQ7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC35C2Q9NQQ7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC35C2Q9NQQ7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC35C2Q9NQQ7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC35C2Q9NQQ7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC35C2Q9NQQ7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC35C2Q9NQQ7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC35C2Q9NQQ7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC35C2Q9NQQ7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC35C2Q9NQQ7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC35C2Q9NQQ7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC35C2Q9NQQ7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC35C2Q9NQQ7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC35C2Q9NQQ7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms