Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Q4

NHEJ1, Non-homologous end-joining factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHEJ1Q9H9Q4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NHEJ1Q9H9Q4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NHEJ1Q9H9Q4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NHEJ1Q9H9Q4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NHEJ1Q9H9Q4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NHEJ1Q9H9Q4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NHEJ1Q9H9Q4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NHEJ1Q9H9Q4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NHEJ1Q9H9Q4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NHEJ1Q9H9Q4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NHEJ1Q9H9Q4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NHEJ1Q9H9Q4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NHEJ1Q9H9Q4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NHEJ1Q9H9Q4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NHEJ1Q9H9Q4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NHEJ1Q9H9Q4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NHEJ1Q9H9Q4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NHEJ1Q9H9Q4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NHEJ1Q9H9Q4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NHEJ1Q9H9Q4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NHEJ1Q9H9Q4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NHEJ1Q9H9Q4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NHEJ1Q9H9Q4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NHEJ1Q9H9Q4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NHEJ1Q9H9Q4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NHEJ1Q9H9Q4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NHEJ1Q9H9Q4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NHEJ1Q9H9Q4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NHEJ1Q9H9Q4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NHEJ1Q9H9Q4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NHEJ1Q9H9Q4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NHEJ1Q9H9Q4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NHEJ1Q9H9Q4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NHEJ1Q9H9Q4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NHEJ1Q9H9Q4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NHEJ1Q9H9Q4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
NHEJ1Q9H9Q4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NHEJ1Q9H9Q4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NHEJ1Q9H9Q4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NHEJ1Q9H9Q4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NHEJ1Q9H9Q4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NHEJ1Q9H9Q4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NHEJ1Q9H9Q4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NHEJ1Q9H9Q4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NHEJ1Q9H9Q4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms