Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PRKRIP1Q9H875 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PRKRIP1Q9H875 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PRKRIP1Q9H875 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PRKRIP1Q9H875 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PRKRIP1Q9H875 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PRKRIP1Q9H875 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PRKRIP1Q9H875 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PRKRIP1Q9H875 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PRKRIP1Q9H875 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PRKRIP1Q9H875 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PRKRIP1Q9H875 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PRKRIP1Q9H875 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.85
PRKRIP1Q9H875 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
PRKRIP1Q9H875 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PRKRIP1Q9H875 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PRKRIP1Q9H875 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PRKRIP1Q9H875 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PRKRIP1Q9H875 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PRKRIP1Q9H875 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PRKRIP1Q9H875 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PRKRIP1Q9H875 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PRKRIP1Q9H875 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PRKRIP1Q9H875 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PRKRIP1Q9H875 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PRKRIP1Q9H875 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PRKRIP1Q9H875 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PRKRIP1Q9H875 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PRKRIP1Q9H875 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PRKRIP1Q9H875 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PRKRIP1Q9H875 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PRKRIP1Q9H875 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PRKRIP1Q9H875 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PRKRIP1Q9H875 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PRKRIP1Q9H875 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PRKRIP1Q9H875 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PRKRIP1Q9H875 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
PRKRIP1Q9H875 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PRKRIP1Q9H875 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PRKRIP1Q9H875 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PRKRIP1Q9H875 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PRKRIP1Q9H875 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PRKRIP1Q9H875 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PRKRIP1Q9H875 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PRKRIP1Q9H875 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PRKRIP1Q9H875 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PRKRIP1Q9H875 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
PRKRIP1Q9H875 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
PRKRIP1Q9H875 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PRKRIP1Q9H875 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PRKRIP1Q9H875 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
PRKRIP1Q9H875 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PRKRIP1Q9H875 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PRKRIP1Q9H875 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PRKRIP1Q9H875 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PRKRIP1Q9H875 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PRKRIP1Q9H875 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PRKRIP1Q9H875 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PRKRIP1Q9H875 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
PRKRIP1Q9H875 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PRKRIP1Q9H875 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PRKRIP1Q9H875 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PRKRIP1Q9H875 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PRKRIP1Q9H875 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
PRKRIP1Q9H875 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PRKRIP1Q9H875 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PRKRIP1Q9H875 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PRKRIP1Q9H875 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
PRKRIP1Q9H875 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PRKRIP1Q9H875 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PRKRIP1Q9H875 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PRKRIP1Q9H875 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
PRKRIP1Q9H875 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PRKRIP1Q9H875 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PRKRIP1Q9H875 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PRKRIP1Q9H875 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
PRKRIP1Q9H875 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PRKRIP1Q9H875 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PRKRIP1Q9H875 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PRKRIP1Q9H875 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PRKRIP1Q9H875 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PRKRIP1Q9H875 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PRKRIP1Q9H875 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PRKRIP1Q9H875 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PRKRIP1Q9H875 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PRKRIP1Q9H875 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
PRKRIP1Q9H875 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PRKRIP1Q9H875 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PRKRIP1Q9H875 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
PRKRIP1Q9H875 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PRKRIP1Q9H875 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PRKRIP1Q9H875 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PRKRIP1Q9H875 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
PRKRIP1Q9H875 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
PRKRIP1Q9H875 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PRKRIP1Q9H875 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PRKRIP1Q9H875 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PRKRIP1Q9H875 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PRKRIP1Q9H875 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PRKRIP1Q9H875 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms