Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDCL3Q9H2J4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDCL3Q9H2J4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDCL3Q9H2J4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDCL3Q9H2J4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDCL3Q9H2J4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDCL3Q9H2J4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDCL3Q9H2J4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDCL3Q9H2J4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDCL3Q9H2J4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDCL3Q9H2J4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDCL3Q9H2J4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDCL3Q9H2J4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDCL3Q9H2J4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDCL3Q9H2J4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDCL3Q9H2J4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDCL3Q9H2J4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDCL3Q9H2J4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDCL3Q9H2J4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDCL3Q9H2J4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDCL3Q9H2J4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDCL3Q9H2J4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDCL3Q9H2J4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PDCL3Q9H2J4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDCL3Q9H2J4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDCL3Q9H2J4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDCL3Q9H2J4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDCL3Q9H2J4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDCL3Q9H2J4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDCL3Q9H2J4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDCL3Q9H2J4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDCL3Q9H2J4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDCL3Q9H2J4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDCL3Q9H2J4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDCL3Q9H2J4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDCL3Q9H2J4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDCL3Q9H2J4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDCL3Q9H2J4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDCL3Q9H2J4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDCL3Q9H2J4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDCL3Q9H2J4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDCL3Q9H2J4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDCL3Q9H2J4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDCL3Q9H2J4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDCL3Q9H2J4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDCL3Q9H2J4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDCL3Q9H2J4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDCL3Q9H2J4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDCL3Q9H2J4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDCL3Q9H2J4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDCL3Q9H2J4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDCL3Q9H2J4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDCL3Q9H2J4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDCL3Q9H2J4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDCL3Q9H2J4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDCL3Q9H2J4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDCL3Q9H2J4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDCL3Q9H2J4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDCL3Q9H2J4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
PDCL3Q9H2J4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDCL3Q9H2J4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDCL3Q9H2J4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDCL3Q9H2J4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDCL3Q9H2J4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDCL3Q9H2J4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDCL3Q9H2J4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PDCL3Q9H2J4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDCL3Q9H2J4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDCL3Q9H2J4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDCL3Q9H2J4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDCL3Q9H2J4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDCL3Q9H2J4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDCL3Q9H2J4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDCL3Q9H2J4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDCL3Q9H2J4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDCL3Q9H2J4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDCL3Q9H2J4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDCL3Q9H2J4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDCL3Q9H2J4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDCL3Q9H2J4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDCL3Q9H2J4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDCL3Q9H2J4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDCL3Q9H2J4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDCL3Q9H2J4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDCL3Q9H2J4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDCL3Q9H2J4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDCL3Q9H2J4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDCL3Q9H2J4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDCL3Q9H2J4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDCL3Q9H2J4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDCL3Q9H2J4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDCL3Q9H2J4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDCL3Q9H2J4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDCL3Q9H2J4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDCL3Q9H2J4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PDCL3Q9H2J4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PDCL3Q9H2J4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PDCL3Q9H2J4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDCL3Q9H2J4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDCL3Q9H2J4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms