Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2F9

CCDC68, Coiled-coil domain-containing protein 68, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC68Q9H2F9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC68Q9H2F9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC68Q9H2F9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC68Q9H2F9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC68Q9H2F9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC68Q9H2F9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC68Q9H2F9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC68Q9H2F9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC68Q9H2F9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC68Q9H2F9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC68Q9H2F9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC68Q9H2F9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC68Q9H2F9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC68Q9H2F9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC68Q9H2F9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC68Q9H2F9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC68Q9H2F9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC68Q9H2F9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC68Q9H2F9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC68Q9H2F9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC68Q9H2F9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC68Q9H2F9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC68Q9H2F9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC68Q9H2F9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC68Q9H2F9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC68Q9H2F9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC68Q9H2F9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC68Q9H2F9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC68Q9H2F9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC68Q9H2F9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC68Q9H2F9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC68Q9H2F9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC68Q9H2F9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC68Q9H2F9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC68Q9H2F9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC68Q9H2F9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC68Q9H2F9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC68Q9H2F9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC68Q9H2F9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC68Q9H2F9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC68Q9H2F9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC68Q9H2F9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC68Q9H2F9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC68Q9H2F9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC68Q9H2F9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC68Q9H2F9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC68Q9H2F9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC68Q9H2F9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC68Q9H2F9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC68Q9H2F9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC68Q9H2F9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC68Q9H2F9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC68Q9H2F9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC68Q9H2F9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC68Q9H2F9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC68Q9H2F9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC68Q9H2F9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC68Q9H2F9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC68Q9H2F9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC68Q9H2F9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC68Q9H2F9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC68Q9H2F9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC68Q9H2F9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC68Q9H2F9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC68Q9H2F9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC68Q9H2F9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC68Q9H2F9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC68Q9H2F9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC68Q9H2F9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC68Q9H2F9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC68Q9H2F9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC68Q9H2F9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC68Q9H2F9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC68Q9H2F9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC68Q9H2F9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC68Q9H2F9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC68Q9H2F9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC68Q9H2F9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC68Q9H2F9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC68Q9H2F9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC68Q9H2F9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC68Q9H2F9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC68Q9H2F9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC68Q9H2F9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC68Q9H2F9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC68Q9H2F9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC68Q9H2F9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC68Q9H2F9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC68Q9H2F9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC68Q9H2F9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC68Q9H2F9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC68Q9H2F9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC68Q9H2F9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC68Q9H2F9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC68Q9H2F9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC68Q9H2F9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC68Q9H2F9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC68Q9H2F9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC68Q9H2F9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC68Q9H2F9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms