Protein–RNA interactions for Protein: Q9H089

LSG1, Large subunit GTPase 1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSG1Q9H089 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LSG1Q9H089 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LSG1Q9H089 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LSG1Q9H089 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
LSG1Q9H089 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LSG1Q9H089 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LSG1Q9H089 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LSG1Q9H089 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LSG1Q9H089 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
LSG1Q9H089 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
LSG1Q9H089 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LSG1Q9H089 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LSG1Q9H089 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LSG1Q9H089 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LSG1Q9H089 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LSG1Q9H089 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LSG1Q9H089 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LSG1Q9H089 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LSG1Q9H089 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LSG1Q9H089 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LSG1Q9H089 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LSG1Q9H089 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LSG1Q9H089 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LSG1Q9H089 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LSG1Q9H089 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LSG1Q9H089 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LSG1Q9H089 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LSG1Q9H089 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LSG1Q9H089 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LSG1Q9H089 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LSG1Q9H089 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LSG1Q9H089 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
LSG1Q9H089 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LSG1Q9H089 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LSG1Q9H089 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LSG1Q9H089 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LSG1Q9H089 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LSG1Q9H089 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LSG1Q9H089 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LSG1Q9H089 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LSG1Q9H089 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LSG1Q9H089 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LSG1Q9H089 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LSG1Q9H089 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LSG1Q9H089 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LSG1Q9H089 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LSG1Q9H089 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LSG1Q9H089 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LSG1Q9H089 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LSG1Q9H089 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LSG1Q9H089 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LSG1Q9H089 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
LSG1Q9H089 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LSG1Q9H089 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LSG1Q9H089 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
LSG1Q9H089 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LSG1Q9H089 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LSG1Q9H089 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LSG1Q9H089 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LSG1Q9H089 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LSG1Q9H089 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LSG1Q9H089 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LSG1Q9H089 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LSG1Q9H089 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LSG1Q9H089 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LSG1Q9H089 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LSG1Q9H089 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LSG1Q9H089 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LSG1Q9H089 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LSG1Q9H089 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LSG1Q9H089 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LSG1Q9H089 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LSG1Q9H089 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
LSG1Q9H089 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LSG1Q9H089 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LSG1Q9H089 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LSG1Q9H089 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LSG1Q9H089 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LSG1Q9H089 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LSG1Q9H089 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LSG1Q9H089 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LSG1Q9H089 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
LSG1Q9H089 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LSG1Q9H089 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LSG1Q9H089 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LSG1Q9H089 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LSG1Q9H089 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LSG1Q9H089 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LSG1Q9H089 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LSG1Q9H089 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LSG1Q9H089 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LSG1Q9H089 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LSG1Q9H089 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
LSG1Q9H089 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
LSG1Q9H089 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LSG1Q9H089 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LSG1Q9H089 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LSG1Q9H089 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LSG1Q9H089 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LSG1Q9H089 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.5 ms