Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LNPKQ9C0E8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LNPKQ9C0E8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LNPKQ9C0E8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LNPKQ9C0E8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LNPKQ9C0E8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LNPKQ9C0E8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LNPKQ9C0E8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LNPKQ9C0E8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LNPKQ9C0E8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LNPKQ9C0E8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LNPKQ9C0E8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LNPKQ9C0E8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LNPKQ9C0E8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LNPKQ9C0E8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LNPKQ9C0E8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LNPKQ9C0E8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LNPKQ9C0E8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LNPKQ9C0E8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LNPKQ9C0E8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LNPKQ9C0E8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LNPKQ9C0E8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LNPKQ9C0E8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LNPKQ9C0E8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LNPKQ9C0E8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
LNPKQ9C0E8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LNPKQ9C0E8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LNPKQ9C0E8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LNPKQ9C0E8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
LNPKQ9C0E8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
LNPKQ9C0E8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LNPKQ9C0E8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LNPKQ9C0E8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
LNPKQ9C0E8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LNPKQ9C0E8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LNPKQ9C0E8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LNPKQ9C0E8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LNPKQ9C0E8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LNPKQ9C0E8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LNPKQ9C0E8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LNPKQ9C0E8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LNPKQ9C0E8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LNPKQ9C0E8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LNPKQ9C0E8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LNPKQ9C0E8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LNPKQ9C0E8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LNPKQ9C0E8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LNPKQ9C0E8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LNPKQ9C0E8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LNPKQ9C0E8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LNPKQ9C0E8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LNPKQ9C0E8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LNPKQ9C0E8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LNPKQ9C0E8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LNPKQ9C0E8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LNPKQ9C0E8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LNPKQ9C0E8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LNPKQ9C0E8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
LNPKQ9C0E8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LNPKQ9C0E8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LNPKQ9C0E8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LNPKQ9C0E8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LNPKQ9C0E8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LNPKQ9C0E8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LNPKQ9C0E8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LNPKQ9C0E8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
LNPKQ9C0E8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
LNPKQ9C0E8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LNPKQ9C0E8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LNPKQ9C0E8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LNPKQ9C0E8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LNPKQ9C0E8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LNPKQ9C0E8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LNPKQ9C0E8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LNPKQ9C0E8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LNPKQ9C0E8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LNPKQ9C0E8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LNPKQ9C0E8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LNPKQ9C0E8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LNPKQ9C0E8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LNPKQ9C0E8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LNPKQ9C0E8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LNPKQ9C0E8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LNPKQ9C0E8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LNPKQ9C0E8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LNPKQ9C0E8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LNPKQ9C0E8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LNPKQ9C0E8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LNPKQ9C0E8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LNPKQ9C0E8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LNPKQ9C0E8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LNPKQ9C0E8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
LNPKQ9C0E8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LNPKQ9C0E8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
LNPKQ9C0E8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
LNPKQ9C0E8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LNPKQ9C0E8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LNPKQ9C0E8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
LNPKQ9C0E8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LNPKQ9C0E8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms