Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMBRA1Q9C0C7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMBRA1Q9C0C7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMBRA1Q9C0C7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMBRA1Q9C0C7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMBRA1Q9C0C7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AMBRA1Q9C0C7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AMBRA1Q9C0C7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AMBRA1Q9C0C7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AMBRA1Q9C0C7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AMBRA1Q9C0C7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AMBRA1Q9C0C7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AMBRA1Q9C0C7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AMBRA1Q9C0C7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AMBRA1Q9C0C7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AMBRA1Q9C0C7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AMBRA1Q9C0C7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMBRA1Q9C0C7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMBRA1Q9C0C7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMBRA1Q9C0C7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMBRA1Q9C0C7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMBRA1Q9C0C7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMBRA1Q9C0C7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMBRA1Q9C0C7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMBRA1Q9C0C7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMBRA1Q9C0C7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMBRA1Q9C0C7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AMBRA1Q9C0C7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMBRA1Q9C0C7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMBRA1Q9C0C7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMBRA1Q9C0C7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
AMBRA1Q9C0C7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AMBRA1Q9C0C7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
AMBRA1Q9C0C7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AMBRA1Q9C0C7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AMBRA1Q9C0C7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AMBRA1Q9C0C7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AMBRA1Q9C0C7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AMBRA1Q9C0C7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AMBRA1Q9C0C7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AMBRA1Q9C0C7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AMBRA1Q9C0C7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AMBRA1Q9C0C7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AMBRA1Q9C0C7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
AMBRA1Q9C0C7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AMBRA1Q9C0C7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AMBRA1Q9C0C7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AMBRA1Q9C0C7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMBRA1Q9C0C7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMBRA1Q9C0C7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMBRA1Q9C0C7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMBRA1Q9C0C7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMBRA1Q9C0C7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMBRA1Q9C0C7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMBRA1Q9C0C7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMBRA1Q9C0C7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMBRA1Q9C0C7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMBRA1Q9C0C7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMBRA1Q9C0C7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMBRA1Q9C0C7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMBRA1Q9C0C7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMBRA1Q9C0C7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMBRA1Q9C0C7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMBRA1Q9C0C7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMBRA1Q9C0C7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMBRA1Q9C0C7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMBRA1Q9C0C7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMBRA1Q9C0C7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMBRA1Q9C0C7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMBRA1Q9C0C7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AMBRA1Q9C0C7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AMBRA1Q9C0C7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
AMBRA1Q9C0C7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AMBRA1Q9C0C7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AMBRA1Q9C0C7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
AMBRA1Q9C0C7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AMBRA1Q9C0C7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMBRA1Q9C0C7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMBRA1Q9C0C7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMBRA1Q9C0C7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMBRA1Q9C0C7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMBRA1Q9C0C7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMBRA1Q9C0C7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMBRA1Q9C0C7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMBRA1Q9C0C7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMBRA1Q9C0C7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMBRA1Q9C0C7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMBRA1Q9C0C7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMBRA1Q9C0C7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMBRA1Q9C0C7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMBRA1Q9C0C7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMBRA1Q9C0C7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMBRA1Q9C0C7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMBRA1Q9C0C7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMBRA1Q9C0C7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMBRA1Q9C0C7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMBRA1Q9C0C7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMBRA1Q9C0C7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMBRA1Q9C0C7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMBRA1Q9C0C7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms