Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTDSS2Q9BVG9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTDSS2Q9BVG9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTDSS2Q9BVG9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTDSS2Q9BVG9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTDSS2Q9BVG9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTDSS2Q9BVG9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTDSS2Q9BVG9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTDSS2Q9BVG9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTDSS2Q9BVG9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTDSS2Q9BVG9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTDSS2Q9BVG9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTDSS2Q9BVG9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTDSS2Q9BVG9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTDSS2Q9BVG9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTDSS2Q9BVG9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTDSS2Q9BVG9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTDSS2Q9BVG9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTDSS2Q9BVG9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTDSS2Q9BVG9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTDSS2Q9BVG9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTDSS2Q9BVG9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTDSS2Q9BVG9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTDSS2Q9BVG9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTDSS2Q9BVG9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTDSS2Q9BVG9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTDSS2Q9BVG9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTDSS2Q9BVG9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTDSS2Q9BVG9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTDSS2Q9BVG9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTDSS2Q9BVG9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTDSS2Q9BVG9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTDSS2Q9BVG9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTDSS2Q9BVG9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTDSS2Q9BVG9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTDSS2Q9BVG9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTDSS2Q9BVG9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTDSS2Q9BVG9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTDSS2Q9BVG9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTDSS2Q9BVG9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTDSS2Q9BVG9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTDSS2Q9BVG9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTDSS2Q9BVG9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTDSS2Q9BVG9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTDSS2Q9BVG9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTDSS2Q9BVG9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTDSS2Q9BVG9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTDSS2Q9BVG9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTDSS2Q9BVG9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PTDSS2Q9BVG9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTDSS2Q9BVG9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTDSS2Q9BVG9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTDSS2Q9BVG9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTDSS2Q9BVG9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTDSS2Q9BVG9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTDSS2Q9BVG9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTDSS2Q9BVG9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTDSS2Q9BVG9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTDSS2Q9BVG9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTDSS2Q9BVG9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTDSS2Q9BVG9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTDSS2Q9BVG9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTDSS2Q9BVG9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTDSS2Q9BVG9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTDSS2Q9BVG9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTDSS2Q9BVG9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTDSS2Q9BVG9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTDSS2Q9BVG9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTDSS2Q9BVG9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTDSS2Q9BVG9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTDSS2Q9BVG9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTDSS2Q9BVG9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTDSS2Q9BVG9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTDSS2Q9BVG9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTDSS2Q9BVG9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTDSS2Q9BVG9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTDSS2Q9BVG9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTDSS2Q9BVG9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTDSS2Q9BVG9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTDSS2Q9BVG9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTDSS2Q9BVG9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTDSS2Q9BVG9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTDSS2Q9BVG9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTDSS2Q9BVG9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTDSS2Q9BVG9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTDSS2Q9BVG9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTDSS2Q9BVG9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTDSS2Q9BVG9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTDSS2Q9BVG9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTDSS2Q9BVG9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTDSS2Q9BVG9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTDSS2Q9BVG9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTDSS2Q9BVG9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTDSS2Q9BVG9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTDSS2Q9BVG9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTDSS2Q9BVG9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTDSS2Q9BVG9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTDSS2Q9BVG9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTDSS2Q9BVG9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms