Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf16Q9BUW7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf16Q9BUW7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf16Q9BUW7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf16Q9BUW7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf16Q9BUW7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf16Q9BUW7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf16Q9BUW7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf16Q9BUW7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf16Q9BUW7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf16Q9BUW7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf16Q9BUW7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf16Q9BUW7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf16Q9BUW7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf16Q9BUW7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf16Q9BUW7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf16Q9BUW7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf16Q9BUW7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf16Q9BUW7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf16Q9BUW7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf16Q9BUW7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf16Q9BUW7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf16Q9BUW7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf16Q9BUW7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf16Q9BUW7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf16Q9BUW7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf16Q9BUW7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf16Q9BUW7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf16Q9BUW7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf16Q9BUW7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf16Q9BUW7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf16Q9BUW7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf16Q9BUW7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf16Q9BUW7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf16Q9BUW7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf16Q9BUW7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf16Q9BUW7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf16Q9BUW7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf16Q9BUW7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf16Q9BUW7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf16Q9BUW7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C9orf16Q9BUW7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C9orf16Q9BUW7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C9orf16Q9BUW7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf16Q9BUW7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf16Q9BUW7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf16Q9BUW7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf16Q9BUW7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf16Q9BUW7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf16Q9BUW7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf16Q9BUW7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf16Q9BUW7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf16Q9BUW7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf16Q9BUW7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf16Q9BUW7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf16Q9BUW7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf16Q9BUW7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf16Q9BUW7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf16Q9BUW7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf16Q9BUW7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf16Q9BUW7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf16Q9BUW7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf16Q9BUW7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf16Q9BUW7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf16Q9BUW7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf16Q9BUW7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf16Q9BUW7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf16Q9BUW7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf16Q9BUW7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf16Q9BUW7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf16Q9BUW7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf16Q9BUW7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf16Q9BUW7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf16Q9BUW7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf16Q9BUW7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf16Q9BUW7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf16Q9BUW7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf16Q9BUW7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf16Q9BUW7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf16Q9BUW7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf16Q9BUW7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf16Q9BUW7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf16Q9BUW7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
C9orf16Q9BUW7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
C9orf16Q9BUW7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf16Q9BUW7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf16Q9BUW7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf16Q9BUW7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf16Q9BUW7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf16Q9BUW7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf16Q9BUW7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf16Q9BUW7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf16Q9BUW7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf16Q9BUW7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf16Q9BUW7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf16Q9BUW7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf16Q9BUW7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf16Q9BUW7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf16Q9BUW7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf16Q9BUW7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms