Protein–RNA interactions for Protein: Q99576

TSC22D3, TSC22 domain family protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC22D3Q99576 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSC22D3Q99576 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSC22D3Q99576 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSC22D3Q99576 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSC22D3Q99576 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSC22D3Q99576 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSC22D3Q99576 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSC22D3Q99576 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSC22D3Q99576 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSC22D3Q99576 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSC22D3Q99576 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSC22D3Q99576 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSC22D3Q99576 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSC22D3Q99576 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSC22D3Q99576 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TSC22D3Q99576 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSC22D3Q99576 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSC22D3Q99576 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSC22D3Q99576 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSC22D3Q99576 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSC22D3Q99576 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TSC22D3Q99576 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSC22D3Q99576 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TSC22D3Q99576 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSC22D3Q99576 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSC22D3Q99576 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSC22D3Q99576 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSC22D3Q99576 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSC22D3Q99576 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSC22D3Q99576 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSC22D3Q99576 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSC22D3Q99576 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSC22D3Q99576 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSC22D3Q99576 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSC22D3Q99576 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSC22D3Q99576 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSC22D3Q99576 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSC22D3Q99576 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSC22D3Q99576 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSC22D3Q99576 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSC22D3Q99576 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSC22D3Q99576 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSC22D3Q99576 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TSC22D3Q99576 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TSC22D3Q99576 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSC22D3Q99576 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSC22D3Q99576 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSC22D3Q99576 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSC22D3Q99576 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSC22D3Q99576 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSC22D3Q99576 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSC22D3Q99576 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSC22D3Q99576 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSC22D3Q99576 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSC22D3Q99576 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSC22D3Q99576 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TSC22D3Q99576 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSC22D3Q99576 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSC22D3Q99576 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSC22D3Q99576 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSC22D3Q99576 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSC22D3Q99576 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSC22D3Q99576 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSC22D3Q99576 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSC22D3Q99576 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSC22D3Q99576 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSC22D3Q99576 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSC22D3Q99576 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSC22D3Q99576 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TSC22D3Q99576 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSC22D3Q99576 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSC22D3Q99576 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSC22D3Q99576 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSC22D3Q99576 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSC22D3Q99576 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSC22D3Q99576 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSC22D3Q99576 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSC22D3Q99576 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSC22D3Q99576 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSC22D3Q99576 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSC22D3Q99576 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSC22D3Q99576 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSC22D3Q99576 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSC22D3Q99576 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSC22D3Q99576 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSC22D3Q99576 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSC22D3Q99576 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSC22D3Q99576 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSC22D3Q99576 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSC22D3Q99576 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSC22D3Q99576 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSC22D3Q99576 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSC22D3Q99576 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSC22D3Q99576 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TSC22D3Q99576 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TSC22D3Q99576 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSC22D3Q99576 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSC22D3Q99576 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSC22D3Q99576 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSC22D3Q99576 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms