Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCF12Q99081 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCF12Q99081 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCF12Q99081 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCF12Q99081 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCF12Q99081 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCF12Q99081 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCF12Q99081 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCF12Q99081 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TCF12Q99081 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCF12Q99081 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCF12Q99081 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCF12Q99081 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCF12Q99081 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCF12Q99081 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCF12Q99081 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCF12Q99081 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCF12Q99081 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCF12Q99081 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCF12Q99081 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCF12Q99081 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCF12Q99081 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCF12Q99081 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TCF12Q99081 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCF12Q99081 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TCF12Q99081 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TCF12Q99081 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TCF12Q99081 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCF12Q99081 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCF12Q99081 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCF12Q99081 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCF12Q99081 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCF12Q99081 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCF12Q99081 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCF12Q99081 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCF12Q99081 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCF12Q99081 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCF12Q99081 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCF12Q99081 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TCF12Q99081 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCF12Q99081 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCF12Q99081 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCF12Q99081 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCF12Q99081 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCF12Q99081 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCF12Q99081 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCF12Q99081 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCF12Q99081 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TCF12Q99081 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCF12Q99081 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCF12Q99081 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCF12Q99081 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCF12Q99081 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCF12Q99081 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCF12Q99081 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCF12Q99081 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCF12Q99081 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCF12Q99081 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCF12Q99081 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCF12Q99081 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCF12Q99081 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCF12Q99081 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCF12Q99081 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCF12Q99081 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCF12Q99081 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCF12Q99081 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCF12Q99081 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCF12Q99081 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCF12Q99081 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCF12Q99081 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCF12Q99081 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCF12Q99081 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCF12Q99081 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCF12Q99081 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TCF12Q99081 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TCF12Q99081 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TCF12Q99081 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TCF12Q99081 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCF12Q99081 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCF12Q99081 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCF12Q99081 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCF12Q99081 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCF12Q99081 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TCF12Q99081 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TCF12Q99081 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCF12Q99081 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCF12Q99081 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCF12Q99081 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCF12Q99081 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCF12Q99081 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCF12Q99081 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCF12Q99081 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCF12Q99081 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TCF12Q99081 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCF12Q99081 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCF12Q99081 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCF12Q99081 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TCF12Q99081 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TCF12Q99081 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TCF12Q99081 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms