Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF3Q96PU9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF3Q96PU9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF3Q96PU9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF3Q96PU9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF3Q96PU9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF3Q96PU9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF3Q96PU9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF3Q96PU9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF3Q96PU9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF3Q96PU9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF3Q96PU9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF3Q96PU9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF3Q96PU9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF3Q96PU9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF3Q96PU9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF3Q96PU9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF3Q96PU9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF3Q96PU9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF3Q96PU9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF3Q96PU9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF3Q96PU9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF3Q96PU9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF3Q96PU9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF3Q96PU9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF3Q96PU9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF3Q96PU9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF3Q96PU9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF3Q96PU9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF3Q96PU9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF3Q96PU9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF3Q96PU9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF3Q96PU9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF3Q96PU9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF3Q96PU9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF3Q96PU9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF3Q96PU9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF3Q96PU9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF3Q96PU9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF3Q96PU9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF3Q96PU9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF3Q96PU9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF3Q96PU9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF3Q96PU9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF3Q96PU9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF3Q96PU9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF3Q96PU9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF3Q96PU9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF3Q96PU9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF3Q96PU9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF3Q96PU9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF3Q96PU9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF3Q96PU9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF3Q96PU9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF3Q96PU9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF3Q96PU9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF3Q96PU9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF3Q96PU9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF3Q96PU9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF3Q96PU9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF3Q96PU9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF3Q96PU9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF3Q96PU9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF3Q96PU9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF3Q96PU9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF3Q96PU9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF3Q96PU9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF3Q96PU9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF3Q96PU9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF3Q96PU9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF3Q96PU9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF3Q96PU9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF3Q96PU9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF3Q96PU9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF3Q96PU9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF3Q96PU9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF3Q96PU9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF3Q96PU9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF3Q96PU9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF3Q96PU9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODF3Q96PU9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODF3Q96PU9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODF3Q96PU9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODF3Q96PU9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODF3Q96PU9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms