Protein–RNA interactions for Protein: Q96NY7

CLIC6, Chloride intracellular channel protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC6Q96NY7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLIC6Q96NY7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLIC6Q96NY7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLIC6Q96NY7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CLIC6Q96NY7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLIC6Q96NY7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLIC6Q96NY7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLIC6Q96NY7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLIC6Q96NY7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLIC6Q96NY7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLIC6Q96NY7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLIC6Q96NY7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLIC6Q96NY7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLIC6Q96NY7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLIC6Q96NY7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLIC6Q96NY7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLIC6Q96NY7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLIC6Q96NY7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLIC6Q96NY7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLIC6Q96NY7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLIC6Q96NY7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLIC6Q96NY7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLIC6Q96NY7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLIC6Q96NY7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLIC6Q96NY7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLIC6Q96NY7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLIC6Q96NY7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLIC6Q96NY7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLIC6Q96NY7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLIC6Q96NY7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLIC6Q96NY7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLIC6Q96NY7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLIC6Q96NY7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLIC6Q96NY7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLIC6Q96NY7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLIC6Q96NY7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLIC6Q96NY7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLIC6Q96NY7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLIC6Q96NY7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLIC6Q96NY7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLIC6Q96NY7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CLIC6Q96NY7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLIC6Q96NY7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLIC6Q96NY7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLIC6Q96NY7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLIC6Q96NY7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLIC6Q96NY7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLIC6Q96NY7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLIC6Q96NY7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CLIC6Q96NY7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CLIC6Q96NY7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLIC6Q96NY7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLIC6Q96NY7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLIC6Q96NY7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLIC6Q96NY7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLIC6Q96NY7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLIC6Q96NY7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLIC6Q96NY7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLIC6Q96NY7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLIC6Q96NY7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLIC6Q96NY7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLIC6Q96NY7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLIC6Q96NY7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLIC6Q96NY7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLIC6Q96NY7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLIC6Q96NY7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLIC6Q96NY7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLIC6Q96NY7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLIC6Q96NY7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLIC6Q96NY7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLIC6Q96NY7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLIC6Q96NY7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CLIC6Q96NY7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLIC6Q96NY7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLIC6Q96NY7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLIC6Q96NY7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLIC6Q96NY7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLIC6Q96NY7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLIC6Q96NY7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLIC6Q96NY7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLIC6Q96NY7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLIC6Q96NY7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLIC6Q96NY7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CLIC6Q96NY7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CLIC6Q96NY7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLIC6Q96NY7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLIC6Q96NY7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLIC6Q96NY7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLIC6Q96NY7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIC6Q96NY7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIC6Q96NY7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIC6Q96NY7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIC6Q96NY7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIC6Q96NY7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIC6Q96NY7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIC6Q96NY7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIC6Q96NY7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIC6Q96NY7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLIC6Q96NY7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLIC6Q96NY7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms