Protein–RNA interactions for Protein: Q96L34

MARK4, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK4Q96L34 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARK4Q96L34 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARK4Q96L34 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARK4Q96L34 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARK4Q96L34 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARK4Q96L34 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARK4Q96L34 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARK4Q96L34 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARK4Q96L34 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARK4Q96L34 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARK4Q96L34 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARK4Q96L34 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARK4Q96L34 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARK4Q96L34 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MARK4Q96L34 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARK4Q96L34 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARK4Q96L34 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARK4Q96L34 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARK4Q96L34 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARK4Q96L34 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARK4Q96L34 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARK4Q96L34 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARK4Q96L34 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MARK4Q96L34 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARK4Q96L34 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARK4Q96L34 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARK4Q96L34 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARK4Q96L34 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARK4Q96L34 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MARK4Q96L34 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MARK4Q96L34 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MARK4Q96L34 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MARK4Q96L34 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MARK4Q96L34 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MARK4Q96L34 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MARK4Q96L34 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARK4Q96L34 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARK4Q96L34 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MARK4Q96L34 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARK4Q96L34 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MARK4Q96L34 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MARK4Q96L34 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MARK4Q96L34 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MARK4Q96L34 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MARK4Q96L34 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MARK4Q96L34 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MARK4Q96L34 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MARK4Q96L34 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MARK4Q96L34 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARK4Q96L34 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARK4Q96L34 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARK4Q96L34 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MARK4Q96L34 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MARK4Q96L34 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MARK4Q96L34 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MARK4Q96L34 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MARK4Q96L34 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MARK4Q96L34 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARK4Q96L34 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARK4Q96L34 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARK4Q96L34 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARK4Q96L34 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARK4Q96L34 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARK4Q96L34 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARK4Q96L34 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARK4Q96L34 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARK4Q96L34 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MARK4Q96L34 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MARK4Q96L34 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MARK4Q96L34 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MARK4Q96L34 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MARK4Q96L34 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MARK4Q96L34 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MARK4Q96L34 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MARK4Q96L34 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MARK4Q96L34 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MARK4Q96L34 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MARK4Q96L34 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MARK4Q96L34 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MARK4Q96L34 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MARK4Q96L34 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MARK4Q96L34 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MARK4Q96L34 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms