Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC35A4Q96G79 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC35A4Q96G79 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC35A4Q96G79 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC35A4Q96G79 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC35A4Q96G79 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC35A4Q96G79 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC35A4Q96G79 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC35A4Q96G79 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC35A4Q96G79 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC35A4Q96G79 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC35A4Q96G79 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC35A4Q96G79 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC35A4Q96G79 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC35A4Q96G79 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC35A4Q96G79 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC35A4Q96G79 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC35A4Q96G79 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC35A4Q96G79 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC35A4Q96G79 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC35A4Q96G79 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC35A4Q96G79 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC35A4Q96G79 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC35A4Q96G79 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC35A4Q96G79 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC35A4Q96G79 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC35A4Q96G79 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC35A4Q96G79 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC35A4Q96G79 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC35A4Q96G79 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC35A4Q96G79 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC35A4Q96G79 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC35A4Q96G79 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC35A4Q96G79 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC35A4Q96G79 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC35A4Q96G79 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC35A4Q96G79 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC35A4Q96G79 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC35A4Q96G79 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC35A4Q96G79 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC35A4Q96G79 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC35A4Q96G79 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC35A4Q96G79 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC35A4Q96G79 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC35A4Q96G79 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC35A4Q96G79 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC35A4Q96G79 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC35A4Q96G79 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC35A4Q96G79 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC35A4Q96G79 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC35A4Q96G79 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC35A4Q96G79 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC35A4Q96G79 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC35A4Q96G79 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC35A4Q96G79 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC35A4Q96G79 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC35A4Q96G79 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC35A4Q96G79 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC35A4Q96G79 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC35A4Q96G79 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC35A4Q96G79 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC35A4Q96G79 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC35A4Q96G79 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC35A4Q96G79 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC35A4Q96G79 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC35A4Q96G79 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC35A4Q96G79 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC35A4Q96G79 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC35A4Q96G79 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC35A4Q96G79 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC35A4Q96G79 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC35A4Q96G79 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC35A4Q96G79 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC35A4Q96G79 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC35A4Q96G79 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC35A4Q96G79 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC35A4Q96G79 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC35A4Q96G79 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC35A4Q96G79 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC35A4Q96G79 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC35A4Q96G79 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC35A4Q96G79 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC35A4Q96G79 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC35A4Q96G79 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC35A4Q96G79 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC35A4Q96G79 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC35A4Q96G79 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC35A4Q96G79 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC35A4Q96G79 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC35A4Q96G79 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC35A4Q96G79 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC35A4Q96G79 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC35A4Q96G79 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC35A4Q96G79 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC35A4Q96G79 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC35A4Q96G79 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC35A4Q96G79 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC35A4Q96G79 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC35A4Q96G79 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC35A4Q96G79 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms